在清兵疲于清剿李自成之时，大明朝残留阵营匆匆忙忙往南部转移，以后才能够在南京等地正立“南大明朝”，而且从此以后传扬“反清复明”标语，召唤世人一块儿反清。朱由崧是南大明朝的首任皇上，为了更好地光复大明他派了一名叫史可法的高官赶往扬州市驻扎，抵御敌军。
殊不知大势已去，拯救大明等于是想孤注一掷而不倒，南明刚创建没多久高官想法不一致。内政难题争吵不休，更何况大明朝主力早被消灭，这时候的南明军队并不想跟渐渐发展壮大的清兵正面抗衡。史可法刚接防扬州市没多久，滔滔不绝的清兵就杀到而且利用包围城池疯狂猛攻，史可法拼死不退，最后英勇殉职。
接着清兵大肆踏入扬州市，展开大规模的杀戮行为，历史上称“扬州十日”。听闻史可法败亡，做在南京城的末代皇帝朱由崧就吓得匆匆忙忙逃跑，可是在逃跑途中被汉奸反叛将其处斩。为此想光复大明的南明政权从这一刻起宣告覆灭。
在武隆政权结束以后，又演变成2个小南明政权。1个是朱由榔的永历政权，另外一个叫绍武朝廷，皇上叫朱聿鐭，两个人全部都是明太祖朱元璋之后，可算作名正言顺了。
这边郑成功哀叹郑之龙的恶行，自己就割裂出去了，他在南边沿海地区自己独立，而且发展得很快，没多久就跟以上的2个小朝权同盟，发起反清复明的革命运动。殊不知绍武跟永历这两南明朝廷却为私利而内讧起来，促使北伐再一次流产。最后一大批清兵杀来，朱聿鐭不幸捕杀，朱由榔则逃跑广西省地区，最后没能完成“光复大明朝”大业。
